Ubuntu 10.04 (lucid)で，深く考えずにホームディレクトリを暗号化してしまった結果， ssh の公開鍵認証ログインができなくなった． というか，ローカルコンソールでログイン済みの時は問題なく ssh でもログインできるが， ローカルでログインしていないと認証に失敗するようになった． よく考えれば，ホームディレクトリに置いている公開鍵を sshd が読めないので認証に失敗するのは当然である．

bear.mini : Ubuntu 9.10 (Karmic Koala) でホームディレクトリを暗号化すると、ssh で公開鍵認証ログインが出来ない問題（解決） や MacBookの憂鬱日記 : sshの設定 その２　っていうか、追記 を参考に，次のようにして解決．

まず，暗号化されていないディレクトリに公開鍵を配置（今回は，/home/.ecryptfs/USERNAME/.ssh/authorized_keys を選んだ） そして，鍵置き場と公開鍵のパーミション設定（/home/.ecryptfs/<username>/.ssh は 700, authorized_keys は 600）． 最後に，sshd_config の編集．具体的には，AuthorizedKeysFile の部分を次のように変更．

AuthorizedKeysFile      /home/.ecryptfs/%u/.ssh/authorized_keys